99%的营养消化吸收靠肠道
肠道是人体主要的消化器官，人体所需的营养物质大约99%由肠道消化（另外1%左右的消化包括了口腔的机械性咀嚼和唾液淀粉酶对淀粉的分解等），100%靠肠道吸收。人体必需的130多种维生素靠肠道有益菌合成。胃的形状像个酒袋，食物储存量可以达到4升。当我们看到美食、闻到香味时，胃就开始强力蠕动收缩，并搅拌进入胃中的食物时，胃腺分泌胃液，胃液含有许多能在胃酸中作用的消化酶，将食物消化成黏稠的液体，称为食糜。胃分泌的胃酸，除了帮助消化酶作用外，还能消灭很多随着食物进入身体的细菌。胃也是一个食物加工储存槽，饱餐一顿后，胃会花2〜4小时，慢慢地将酸性的食糜，在胃下端调成中性后，分批送入小肠。
小肠最初的一段一十二指肠，长度相当于12根手指的宽度，肝脏制造的胆汁和胰脏制造的胰液，都送入十二指肠。胆汁含有大量胆汁酸，具有杀菌的作用，是人体的第二道天然屏障；胰液则含有多种消化酶，能帮助蛋白质、脂肪的消化。胃酸和胆汁被称为人体的二道天然的屏障是相对于有害的细菌而言的，而在另一方面，如何挑选出耐胃酸胆汁的益生菌菌株并加上保护剂使益生菌能在肠道发挥作用，是益生菌研究人员面临的挑战。小肠的第二部分是长约2丨5米的空肠，消化作用大部分在这里进行；
第三部分是长约3.5米的回肠，负责吸收大部分的养分。小肠强大的吸收功能源于小肠中布满的数以百万计的绒毛，而且绒毛内部就是密密麻麻的微血管、乳糜管等，可以将吸收进来的养分，快速输送到全身，构成一个高效率的养分吸收及运送系统。